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在西班牙全国性的足球比赛开始之前，塞维利亚曾经赢得17座安达鲁西亚锦标赛，以及2次获得塞维利亚市的冠军。在西甲联赛成立后乃塞维利亚全盛时期，虽然只曾于1946年赢过一届冠军，但大部分时都在联赛榜前列，赢过4届西甲联赛亚军。

自1960年代以后塞维利亚实力每况愈下，只能在低组别联赛打滚，至1990年代末才重新升上甲组。2005-06年赛季更赢得欧洲足联杯冠军。2007年赛季卫冕欧洲联盟杯成功，是自1986年皇家马德里后第一支成功卫冕欧洲联盟杯的球队。

2007年8月28日，在07-08赛季西甲联赛首轮对赫塔费的比赛中因突发心脏病倒下的塞维利亚球员安东尼奥·安东尼奥·普尔塔抢救无效逝世，而原有之16号球衣则提早退役至被其他球员接手止。

2014至2016年，塞维利亚于欧洲联赛表现出色，连续3届成为冠军，不过在2016年的夏天，带领球队创造这个纪录的主教练乌奈·埃梅里离开了球队前往巴黎圣日耳曼，不过塞维利亚成功邀请到曾率领智利夺下美洲杯的豪尔赫·桑保利担任球队的新主教练。

2015年11月25日，塞维利亚在欧冠小组赛倒数第二轮爆冷不敌门兴格拉德巴赫，积分一度排名小组垫底。由于最后一轮塞维利亚将要面对尤文图斯，并且需要寄托曼城击败门兴格拉德巴赫才能跻身小组第三。由于尤文图斯是应届亚军，且最后一轮对于尤文图斯也至关重要，加上曼城此前并未取得过小组第一，所以大多数人并不看好塞维利亚的卫冕之路。12月8日，面对尤文图斯的比赛中，上半场曼城爆冷落后门兴，塞维利亚晋级局面显得艰难。下半场66分钟，乌克兰中场耶夫恩·科诺普里安卡助攻费尔南多·略伦特打入致胜进球。但由于曼城依然落后，塞维利亚即便赢球也无济于事。77分钟、79分钟，曼彻斯特城由拉希姆·斯特林梅开二度，打入为曼城扳平与反超的两粒进球。凭借曼城的胜利，塞维利亚最终在积分上艰难压过门兴格拉德巴赫，以小组第三的身份晋级欧联杯32强，并一路杀进决赛拿下冠军。

2016年12月8日，塞维利亚在欧冠小组赛最后一轮客场0比0战平里昂，成功晋级欧冠淘汰赛，俱乐部也无缘创造欧洲联赛4连冠的历史。[2]他们在淘汰赛遇上英超冠军莱斯特城，主场作战时在罚失两个点球的情况下以2比1战胜对手，但是在客场0比2落败，总比分2比3被淘汰，欧联杯之王的欧冠之路从此画下句点。[3]

2017年1月16日，塞维利亚在主场2比1战胜皇家马德里，终结对手的40场不败战绩，1月22日，俱乐部客场4比3战胜奥萨苏纳，13胜3平3负积42分，为俱乐部队史最佳西甲半程战绩。[4]不过球队在之后遇到了严重的伤病潮，联赛一度五轮不胜，欧冠也被淘汰出局，联赛最后积72分排名第四，可以参加下赛季的欧冠附加赛，在赛季结束后主教练桑保利宣布与球队解约，前往执教阿根廷国家队。[5]

2018年3月14日，塞维利亚爆冷击败曼彻斯特联，历史上第一次进入欧冠八强，随后不敌拜仁慕尼黑。比赛中，塞维利亚球员多次对拜仁慕尼黑球员恶意犯规。2019年6月4日，塞维利亚宣布签下尤伦·洛佩特吉作为接下来三个赛季的主教练。[6]

2020年8月16日，塞维利亚以2-1击败曼联，在2019-2020赛季欧联杯半决赛中取得胜利。[7]2020年8月22日，塞维利亚以3-2战胜国际米兰，夺得队史第六座欧联杯。[8][9]

2023年6月1日，塞维利亚历经加时赛1-1，点球大战4-1战胜罗马夺得队史第七座欧联杯。[10]